Pierre Aupert fut élève de Philippe Bruneau, puis de Pierre de La Coste-Messelière en architecture antique, de Louis Robert en épigraphie et de Paul Courbin en technique de fouille. Agrégé ès lettres classiques et enseignant en Algérie, il a relevé et publié le nymphée de Tipasa, puis, membre de l’École d’Athènes, le stade de Delphes, et il a fouillé les temple-thermes d’Argos, objet de sa thèse. Secrétaire général de l’institution athénienne, puis directeur de recherche au CNRS, il a créé et dirigé pendant 28 ans la Mission archéologique française, ainsi que des chantiers en France, où il a fondé la collection Architecture de la Gaule romaine. À Amathonte, il a engagé les publications avec le Guide du site, le premier volume de Amathonte I : Testimonia (avec Marie-Christine Hellmann, EFA, 1984) et 32 articles d’épigraphie et d’histoire. Le Nymphée de Tipasa et les nymphées et septizonia nord-africains (EFR, 1974) ; Le stade [de Delphes] (EFA, 1979) ; Saint-Bertrand-de-Comminges II. Les thermes du Forum (Aquitania, 2001) et Barzan II. Le sanctuaire au temple circulaire (Ausonius, 2010) sont ses principales monographies.